关于题目自带数据

sunruij · 发表于 2012-9-23 09:37:59

专家您好！就是题目自带的四个。
（1）AB304259.1（酿酒酵母ATP1a，ATP1b，为F1F0- ATP酶复杂，完整的CD ATP1c基因）
（2）AF100306.1(线虫粘粒T24C4，完整序列)
（3）CP002688.1((拟南芥染色体5，序列1-21000)
（4）NC_012920_1(人线粒体全基因组)
里面一段一段的DNA序列都是外显子吗？还是有外显子和内含子都有。

A题专家 · 发表于 2012-9-23 09:57:53

编码区间（即外显子）信息在基因数据中就是对应CDs或location的那些内容。
另外，DNA序列数据大家完全可以自己从基因数据库下载，不必拘于题目中给的基因数据。

Yohan · 发表于 2012-9-23 12:54:46

编码区间（即外显子）信息在基因数据中就是对应CDs或location的那些内容。
另外，DNA序列数据大家完全可以 ...
A题专家发表于 2012-9-23 09:57

dayong · 发表于 2012-9-23 13:02:24

回复 2# A题专家

您说，DNA序列数据大家完全可以自己从基因数据库下载，不必拘于题目中给的基因数据，可是需要需要AccessionNumber，我们不知道，怎么下啊？

A题专家 · 发表于 2012-9-23 13:09:46

比如可以在NCBI网站通过基因物种的英文名称去搜索。

truthhurts · 发表于 2012-9-23 15:23:30

回复 2# A题专家
专家您好!
今天看了下exon，CDS，ORF的概念，感觉对外显子的概念更加模糊了。
有文章说，现在对exon有两种理解：1. exon就是ORF,exon不含UTR
2. exon是ORF和UTR合起来的总称
那么我们自己做程序判断时，拿txt文件中的CDS对应的location作为外显子区间作为标准是正确的吗？
（附文章链接：http://blog.163.com/little_goldy ... 702008101204947947/）

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